hallo grisu,
nun, deine frage(n) könnte man mit einem ganzen buch beantworten

.
aber erstmal drängt sich mir die frage auf, warum du deine magnolie schneiden musst. du schreibst von einem wunderschönen, alten exemplar. verwachsen ist relativ. auch äste "die am boden entlang" wachsen können durchaus malerisch sein.
alles in allem stelle ich mir die von dir beschriebene magnolia zauberhaft verwunschen vor. mein gefühl sagt mir, ich würde so wenig wie möglich und nur so viel wie notwendig schneiden.
ich bin aber auch kein träumender realitätsverkenner, um nicht zu wissen, das in manchen gartensituationen große niedrig wachsende äste ein problem sein können. diese hätte man natürlich schon viel früher, als sie noch geringeren durchmesser hatten schneiden.
und weil ich gerade beim stichwort bin: welchen durchmesser haben die äste, die du schneiden möchtest?
und du hasat recht; magnolien sollte man einfach wachsen lassen. man kann getrost totes holz, sich überkreuzende oder kranke zweige herausschneiden. und bei dünneren ästen ist das auch absolut unproblematisch.
große schnittstellen sind aber für alle gehölze problematisch, denn sie stellen quasi ein einfallstor für pilzsporen dar, die jedenfalls - auf die gesamtlebensdauer des gehölzes bezogen - lebenserwartungvermindernd sind.
wenn es sich nun absolut nicht vermeiden lassen sollte (gehe nochmal in dich

), dann lass keinen stummel stehen, mache aber auch keinen stammparallelen schnitt. du solltes den schnitt möglichst genau am astkragen ansetzten. so kann der baum barrirezonen aufbauen und mit der überwallung beginnen bzw. findet er so ideale voraussetzungen dafür. schnittzeitpunkt ist jetzt in der vegetationsperiode mE auch besser, da das gehölz reagieren kann (in den zellen bilden sich chemische barrierezonen, der baum kompartimentiert (ich hoffe, ich erinnere mich korrekt an diesen ausdruck) den absterbenden, verbleibenden astkegel (vom astkragen stammeinwärts). in der ruheperiode kann er das nicht.
aber nochmal: tiefe äste können nicht nur stören, sondern auch malersich wirken. vielleicht kannst du sie mit kosmetischen entfernungen kleinerer äste wirkungsvoll, optisch freilegen und in szene setzte.
dendrophilosophischen gruß,
bernhard